行政室
当センターに関するすべての業務を統括および管理する事務室で、2003年の設立以降、多くの日本の大学との交流行事やセミナー開催を担当している。毎年1回開催している日韓次世代学術フォーラムをはじめ、日韓新時代フォーラム、釜山ー福岡フォーラムなどの事務局も構えている。また、教養科目の「アジア共同体論」も運営し、本校の学生を対象に上質の教育機会を提供している。
閲覧室
各種日本書籍と最新の日本の雑誌(週刊誌、月刊誌)を配置し、本学関係者であれば自由に閲覧できる。また、自習や日本人留学生との会話が可能なスペースを設け、本校の学生をはじめ多くの方々に学びの場を提供している。
セミナー室
主に各種行事の際に使用し、2021年はじめに構築した最新の画像システムではオンラインによる会議や国際学術大会を積極的に行っている、コロナ時代を迎え、今後も多様なオンラインイベントに活用する予定である。
書庫
日本に関する様々な書籍、また、これまでに当センターが主催した研究および調査資料なども保管している。
行政室
日本研究センターソウル事務室は、ソウルで行われる当センターに関するすべての業務を担当および統括している。2009年からは、日韓両国のマスコミ関係者、大学教授、外交官などが参加するセミナー兼討論会の日本研究センターセミナー(旧東西サランバン)を活発に開催している。また、日韓民間交流の拠点として、日韓関係書籍出版支援および各種セミナー主催・支援など、多様な活動も展開している。